集團本部設辦公室（黨委辦、董事會辦、總經理辦）、黨群工作部（人力資源部）、規劃發展部、財務部、融資管理一部、融資管理二部、工程管理部、法務合規部、審計部、紀檢監察室10個內設機構以及市紀委監委派駐集團公司紀檢監察組辦公室，下屬擁有南充經開資產經營管理有限公司、南充經開城鎮投資建設有限責任公司、南充經濟開發區市政工程有限公司3家全資二級公司，以及南充經開物聯網有限公司、南充經開貿易有限公司、南充經開智慧城市管理有限公司、南充經開污水處理有限公司、南充經開健康管理有限公司、南充經開置業有限公司6家三級公司和南充經濟開發區實業發展有限公司1家控股二級公司，參股南充川港經開燃氣有限公司。